Juan Pablo Cáceres pasó gran parte de la década de los 2000 en un doctorado en la Universidad de Stanford (San Francisco), asistiendo a las cátedras de pioneros en la computer music como Max Matthews, o en talleres de composición con Chris Chafe, en el centro de investigaciones de música computacional. En esos avanzados centros de estudio comenzó a ampliar su naciente catálogo de música electroacústica mixta e incluso obtuvo un importante premio en Tokio por su obra “Chamber of the late half hour”. En 2005 editó su primer álbum acusmático (música construida únicamente sobre soporte electrónico) configurado a través de un gesto de artesanía futurista y entramado por múltiples y minúsculas muestras de sonidos reales obtenidos del instrumental de una gran orquesta sinfónica al que tituló, simplemente, Orquesta.

Desde entonces ha sido profesor en la propia Universidad de Stanford, y ha trabajado en su Centro de Investigación Informática en Música y Acústica (CCRMA). Algunas de sus obras de diverso formato son "Divertimento rítmico" (2007), para dos sintetizadores; "Give a man an orchestra and he doesn't become us" (2007), improvisación con laptop; "NET: Disturbances" (2008), para sintetizadores y saxo alto, y "Canned bits mechanics" (2009), para dos pianos, entre otras composiciones de su catálogo.