Tras una larga búsqueda de integrantes y luego de una serie de ensayos y tocatas, el grupo edita un demo en 1998 titulado "Fencer". Un paso adelante en el desarrollo de la banda se da poco tiempo después, cuando graban el EP Contacto en el estudio Konstantinopla de Carlos Cabezas, titulado "Contacto" y del cual saliron dos singles promocionales que alcanzaron alguna rotación en radios como la Concierto y la Futuro. Así, un año después el conjunto graba un nuevo trabajo, que titulan "Ameba" y que promocionan con nuevas presentaciones en vivo, interrumpidas por el alejamiento de tres de sus integrantes, lo que establece una pausa momentánea en la carrera de Crisálida.

Las actividades volverían para el grupo en 2004, cuando, junto al bajista Braulio Aspe comienzan a crear nuevas composiciones. El 2006 ingresa otro miembro, Rodrigo García en el bajo, lo que ayuda a consolidar la nueva etapa de la banda, que en 2006 graba en junto a Juan Ricardo Weller el disco Crisálida, en los estudios de este último.

Al poco tiempo son invitados a telonear al grupo holandés The Gathering, lo que constituye uno de los hitos en la carrera del grupo. Posteriormente se retiran Manuel Soto y Rodrigo García siendo reemplazados por Felipe Troncoso y Rodrigo Castro. La formación actual está establecida por Sánchez y Santibáñez junto a Manuel Soto (teclados), Cristián Carillo (guitarra) y Rodrigo Castro (bajo).